胃溃疡和胃癌在胃镜下有时比较容易鉴别。胃癌按照大体形状分型：（隆起型）肿块型、局限溃疡型、局灶浸润型和弥漫浸润型。如果胃癌是在胃腔内隆起的肿块或者向胃腔内外生长的肿块，那么和一般的胃溃疡（胃粘膜的局灶糜烂）是比较容易区分的。
但有时候在胃镜下比较难区别。尤其是胃癌是溃疡浸润型或者弥漫浸润型，此时胃癌可称为癌性溃疡，此时的癌灶外观大概和普通的胃溃疡不容易分别。胃粘膜表面的溃烂，但是二者在形态、溃疡的深度和溃疡周围正常粘膜的改变上还是有一定的区别的。不管二者在外观形态上是否有明显的区别，真正的鉴别手段就是胃镜下取活检，根据病理结果来明确区别。但是，有时胃癌合并溃疡的患者，可能需要多次胃镜活检才能明确，有时虽然是胃癌，但是同时合并了胃炎和胃溃疡，活检时没有取到癌细胞，只是报告慢性胃炎或胃溃疡，此时不能侥幸认为就是没事，如果上腹部不适症状明显或者其它的检查手段高度怀疑胃癌是，要引起重视，可以口服治疗胃溃疡的药物2-3周，然后重新取活检，不少患者是经过2-4次的活检才明确诊断的。
此外，二者的治疗方案也是不同的。现在由于质子泵抑制剂的广泛应用，胃溃疡治疗效果很好，现在很少有因胃溃疡行手术治疗的，除非合并了胃穿孔或胃出血或溃疡导致的幽门梗阻，才需要手术处理。而胃癌的治疗，是以手术为主的综合治疗方案。
二者的预后也是有很大差别的，胃溃疡一般不会导致生命危险，但是恶性肿瘤如果病期偏晚，治疗效果就会大打折扣，有时会危及生命。
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